海马齿根系响应盐胁迫的转录组分析

作者：李卫锦; 钟才荣; 张颖; 袁长春; 李仁茂^*

来源：南方农业学报, 2022, 53(03): 693-703.

DOI：10.3969/j.issn.2095-1191.2022.03.011

• 海马齿
• 根
• 盐胁迫
• 转录组
• 耐盐基因

【目的】对盐胁迫下海马齿根系进行转录组测序分析，挖掘海马齿根系耐盐相关基因，为揭示海马齿耐盐的分子机制提供参考。【方法】利用Illumina测序技术对0 mmol/L NaCl（对照组）和400 mmol/L NaCl胁迫处理（盐胁迫处理组）下的海马齿根系进行转录组测序分析，从中筛选出差异表达基因，选取13个基因进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测，以验证转录组数据的可靠性。【结果】在海马齿根系转录组中共鉴定出305145个转录本，平均长度为622 bp，其中，对照组有146177个长度>300 bp的转录本，盐胁迫处理组有72173个长度>300 bp的转录本；共有65535条Unigenes在Nr、GO、Swiss-Prot、COG和KEGG五大数据库注释成功，占Unigenes总数的52.36%。对照组和盐胁迫处理组共有65535个差异Unigenes，其中，有182个热休克蛋白基因。对照组和盐胁迫处理组间共有24042个差异表达基因，从中选取13个基因进行q RT-PCR检测，结果显示，9个基因表达上调，其余4个基因表达下调，与转录组测序结果一致。24042个差异表达基因中，共有10106个显著差异基因富集到129条代谢通路，其中富集程度排名前10的代谢途径为核糖体、次级代谢生物合成、RNA转运、内吞作用、剪接体、甘油磷脂代谢、内质网加工、吞噬、醚脂类代谢和植物-病原体相互作用，参与盐胁迫相关的硫代谢、脯氨酸积累、活性氧（ROS）代谢、与盐胁迫相关的钙信号通路和过氧化氢代谢等途径的差异基因上调。【结论】在盐胁迫下海马齿差异表达基因如小分子量热激蛋白基因、抗氧化酶相关基因及与离子交换相关基因发挥了重要调控作用。

• 单位
  岭南师范学院