茶网蝽线粒体基因组全序列测定及系统发育分析

作者：杨金宏; 谢满超; 文欣茹; 陈蕊茹; 孔卫青^*

来源：茶叶科学, 2022, 42(06): 839-850.

DOI：10.13305/j.cnki.jts.2022.06.007

• 茶网蝽
• 线粒体基因组
• 序列分析
• 系统发育

为明确茶网蝽（Stephanitis chinensis）线粒体基因组序列特征，探究其系统发育地位。利用Illumina和Sanger测序对陕西省安康市茶网蝽线粒体基因组进行测定。结果显示，茶网蝽线粒体基因组全长18 085 bp，包含37个基因（13个蛋白质编码基因，22个tRNA,2个rRNA）和1个3 678 bp的控制区，基因排列与昆虫线粒体祖先基因顺序（Ancestralgeneorder）相同。基因组AT含量为78.10%。13个蛋白质编码基因中，6个以ATG起始，7个以ATT或ATA起始，10个以TAA或TAG为终止密码子，cox2、atp6和cox3以T终止，蛋白质编码基因使用频率最高的密码子是UUA、AUU、UUU和AUA，使用频率最高的氨基酸为亮氨酸（Leu）、异亮氨酸（Ile）、苯丙氨酸（Phe）和丝氨酸（Ser）。22个tRNA基因存在GU、UU、GA和AA错配23处，trnS1(GCU)缺少DHU臂，其他tRNA均能形成典型三叶草结构。控制区包含位于前端的3种非串联重复、4个(TTAG)n和1个位于后端的串联重复序列，含有多个茎环结构。系统发育分析结果表明，茶网蝽与直脊冠网蝽（Stephanitis mendica）的亲缘关系最近，所有网蝽科聚为一簇，位于发育树的根部。

• 单位
  安康学院