21个物种生长激素基因完整编码区比较基因组学分析

作者：宋兴超; 孟金柱; 赵园园; 吴震洋; 安清明^*

来源：特产研究, 2022, 44(05): 107-114.

DOI：10.16720/j.cnki.tcyj.2022.139

• 生长激素基因
• 遗传多样性
• 马鹿
• 比较基因组学
• 物种

为探究不同物种生长激素（GH）基因的遗传变异及多样性，本研究基于比较基因组学方法对NCBI数据库中马鹿、绵羊、山羊、牛、家马、猪、人、狨、猕猴、家犬、家猫、水貂、小家鼠、褐家鼠、原鸡、火鸡、鹌鹑、野鸭、鹅、草鱼和斑马鱼共计21个物种的GH基因完整编码区序列进行了系统的生物信息学分析，进一步对不同物种该基因编码氨基酸序列的理化特性、亲水性、信号肽裂解位点及二级结构进行了预测，构建了马鹿GH蛋白三维结构模型。结果表明，21个物种150条GH基因序列中检测到426个多态位点，共生成92种单倍型；GH基因在物种间的遗传多样性比较丰富，种内相对保守；绵羊与山羊亲缘关系最近，草鱼与其他物种亲缘关系最远；除马鹿、绵羊、山羊、牛、火鸡和鹌鹑外，其他物种GH蛋白理论等电点大多低于7.00，属不稳定酸性蛋白，均存在1个信号肽且亲缘关系较近的物种具有相似的裂解位点；马鹿GH基因编码氨基酸序列的二级结构元件以-螺旋和无规则卷曲为主，GH蛋白三级结构存在4个反向平行的互补螺旋。该研究结果可为进一步分析和研究GH基因功能及其应用奠定基础。

• 单位
  铜仁学院