白菜CesA基因家族鉴定及表达模式分析

作者：马宇辰; 赵玉梅; 黄丹霖; 张梦晴; 吴晓宇; 王洁; 陈雨; 黄家保; 段巧红

来源：广西植物, 2022, 42(12): 1-14.

• 纤维素合成酶
• 白菜
• CesA
• 基因家族
• 基因表达

为探究CesA基因家族在白菜生长发育及纤维素合成过程中的作用机制，该研究通过生物信息学的方法，以白菜的全基因组序列为研究区域，进行了理化特征、基因结构、进化特征、保守基序及结构域、顺式作用元件和组织表达等鉴定分析。结果表明:（1）白菜基因组中鉴定出16个编码纤维素合成酶亚基的CesA基因，该家族成员所编码蛋白的理论等电点介于4.76～9.12，相对分子量17.76～122.67kD，长度153～1 089 aa;(2)其中15个基因不均匀地分布于白菜的7条染色体上，Bra036008定位于scaffold上；（3）大部分成员包含4-14个外显子，1-11个保守基序；（4）序列比对显示该家族具有保守的DDD-QXXRW保守功能域；（5）该家族编码蛋白主要分布在质膜上，二级结构以无规则卷曲与α-螺旋为主，多数成员都含有CesA蛋白典型的N端、C端和跨膜区；（6）CesA基因在茎中表达量相对较高，其中Bra011865、Bra023952和Bra029874在茎、叶、花中显著表达。该研究利用生物信息学方法对白菜CesA基因家族进行了全基因组鉴定，为后续深入研究CesA基因功能奠定了基础，也为白菜生长发育研究奠定基础。

• 单位
  山东农业大学; 作物生物学国家重点实验室