摘要
为探究刺槐TCP转录因子在刺槐生长发育过程中的功能,本研究利用生物信息学方法对刺槐TCP (RpTCP)基因家族进行了全基因组鉴定和分析,通过亚细胞定位技术和实时荧光定量PCR技术分析了RpTCP1和RpTCP19两个成员的表达情况。从刺槐基因组数据库中共鉴定出23个TCP成员,不均匀地分布在10条染色体上。这些蛋白质由200~638个氨基酸残基组成,等电点介于6.07~10.03之间,均为不稳定的亲水性蛋白。系统进化发现刺槐TCP家族成员被分为两大类,保守基序和基因结构与进化关系基本一致。共线性分析发现有19个成员参与片段复制事件,22个成员与大豆TCP基因家族存在共线性关系。启动子区域中包括大量响应光、生长素素、茉莉酸甲酯和响应干旱、低温胁迫等的顺式作用元件。RpTCP1和RpTCP19亚细胞定位均在细胞核内,在叶片和刺中均有较高的表达量。综上,本研究为进一步研究TCP基因家族在刺槐生长发育过程中的功能提供了依据。
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