油棕乙酰CoA羧化酶(ACC)基因的鉴定与表达分析

作者：肖勇; 雷新涛; 王永; 曹红星; 石鹏; 金龙飞; 夏薇

来源：安徽农业科学, 2017, 45(31): 154-155+159.

DOI：10.3969/j.issn.0517-6611.2017.31.049

• 油棕
• ACC基因
• 转录组
• RPKM

[目的]对油棕乙酰CoA羧化酶(ACC)基因进行鉴定与表达分析。[方法]采用生物信息学方法鉴定油棕的ACC基因,并应用拟南芥的ACC基因蛋白质序列比对油棕的蛋白质库,应用已有油棕转录组信息,研究ACC基因在不同组织中的表达情况。[结果]在油棕中鉴定了2个ACC基因,命名为EgACC1和EgACC2。EgACC1不含内含子,而EgACC2含有32个内含子;EgACC1在不同组织中都没有表达,而EgACC2在所有组织中都有表达,其中在组培苗中有较高的表达量,同时,在油棕果发育21 d时有高的表达水平,RPKM值为70.6,为所有组织中最高。[结论]该研究阐述了油棕ACC基因的表达模式,为油棕ACC基因的功能分析奠定了基础。

• 单位
  中国热带农业科学院椰子研究所