Ⅰ型登革病毒在中国的传播及进化

作者：李代英; 鲁明; 朱海莲; 何丽存; 顾冉; 张娟; 陈俊英; 潘玥; 孙强明^*

来源：中国生物制品学杂志, 2021, 34(05): 522-527.

DOI：10.13200/j.cnki.cjb.003329

• 登革病毒
• 登革热
• 传播
• 系统进化分析

目的研究近年来中国境内登革病毒(Dengue virus,DENV)流行株分布与东南亚株的联系,分析传播规律,追溯传入源头,探讨其系统发育和分子进化特征。方法以公共卫生科学数据中心公布的病例数分析国内Ⅰ型DENV(Dengue virus-1,DENV-1)感染及分布情况,收集NCBI中自1985年来在中国境内流行的405株DENV-1毒株全基因序列,使用在线工具MAFFT进行序列对比,并通过ATGC网站在线PhyML构建进化树。基于进化树分析结果挑选40余个代表性毒株与东南亚代表株序列,使用MEGA X软件进行系统进化树分析;随后对中国DENV-1流行株序列进行重组进化分析。结果自2004—2017年间国内共有66 623人感染登革热,其中广东省每年均有DENV-1病例报道,自2012年以来,DENV-1引起的病例数呈现了迅速增加的情况,地域范围不断扩大。国内流行株与东南亚国家流行株存在密切联系,不断出现输入病例,同时也存在广东省向东南亚地区输出DENV-1的可能。云南省存在由边境从中南半岛地区国家传入DENV流行株,并之后在云南长期流行的现象。云南省输入毒株与广东省输入的DENV毒株差异较大,可认为其DENV毒株输入来源不同。24个代表株的重组分析结果表明,虽然2017年广东株MN018297部分序列与2014年广东株KP723476相似,但未发现更多的重组现象。结论通过将中国境内DENV-1毒株汇总后进行系统进化树的构建,分析并挑选出代表性株后进行分析,发现了DENV毒株传入中国主要经由的省份,并结合氨基酸位点的比对分析DENV在中国境内流行分支,为研究DENV-1在中国的传播和进化提供了参考。

• 单位
  中国医学科学院医学生物学研究所