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摘要
为探究全州禾花鲤乌褐色、半透明的经济体色性状，发掘全州禾花鲤的皮肤基因信息，以全州禾花鲤的皮肤组织为研究对象，利用高通量测序技术进行转录组比较分析。结果显示，全州禾花鲤和建鲤（对照）的皮肤组织转录组测序获得37 066 778～58 708 166条clean reads,Q30在94.96%以上，GC碱基比例在51.00%左右；发现新基因10 537个，检测出单核苷酸多态性（SNP）位点1 278 906个、插入缺失（InDel）位点80 238个。筛选显著差异基因11 717个，其中上调基因5 133个，下调基因6 584个。GO注释到56个二级分类，显著富集的GO条目127个，主要集中在生物学过程和细胞组分；KEGG分析获得显著富集通路60个；网络分析结果显示，以代谢途径（Metabolic pathways）、p53信号通路（p53 signaling pathway）和细胞周期（Cell cycle）通路作为网络核心，与众多KEGG通路关联且相对独立。
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