简单重复序列标记和序列相关扩增多态性标记在草莓遗传多样性分析中的比较

作者：忻雅; 方献平; 王淑珍; 童建新; 来文国; 汪建荣; 余红^*

来源：浙江大学学报(农业与生命科学版), 2019, 45(03): 278-287.

• 草莓
• 简单重复序列
• 序列相关扩增多态性
• 遗传多样性

利用简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)和序列相关扩增多态性(sequence related amplified polymorphism, SRAP)标记分析了来自国内外43个草莓品种的遗传多样性,并比较了这2种分子标记的效果差异。结果表明:30对SSR引物平均多态性位点数为6.43个,每个位点的平均多态性信息含量(polymorphism information content, PIC)值为0.628 4;20个SRAP引物组合平均多态性位点数为14.30个,PIC值高达0.911 4。基于SSR标记的聚类结果与基于SRAP标记的聚类结果的相关系数为0.817,呈显著水平。而SSR标记、SRAP标记分别与SSR+SRAP联合标记的相关系数为0.938和0.966,都达到极显著水平。SSR和SRAP标记都能较好地分析草莓遗传多样性,其中SRAP标记的效果略优于SSR标记,而SSR+SRAP联合标记分析则能更好地评估种质的遗传多样性和亲缘关系。

• 单位
  杭州市农业科学研究院; 上海市农业科学院