核桃CDPK基因家族鉴定与转录表达分析

作者：庄丽丽; 宋林眉; 王芳; 李玉群; 张柱岐; 刘凯^*

来源：落叶果树, 2023, 55(06): 32-35.

DOI：10.13855/j.cnki.lygs.2023.06.007

• 核桃
• 冷胁迫
• CDPK家族
• 表达分析

钙依赖型蛋白激酶(CDPK)在植物响应逆境胁迫过程中起着重要作用，本研究在核桃全基因组数据库中利用隐马尔可夫模型鉴定CDPK家族成员基因，对该家族成员进行了结构分析，并对冷胁迫和不同组织的转录水平进行分析。结果显示，核桃CDPK基因家族包含38个成员，开放阅读框为399～2 181 bp,蛋白大小为132～645个氨基酸，等电点为5.34～9.14,亚细胞定位预测该38个基因均定位于细胞核。在清香核桃冷胁迫不同时间后进行转录表达分析，发现JrCDPK4呈现显著上升趋势，并在根和嫩叶中表达较高，推测该基因可能参与响应冷胁迫以及根、嫩叶的生长发育，本研究结果为进一步研究该基因响应冷胁迫的机理奠定了基础。

• 单位
  滨州职业学院