基质金属蛋白酶-9被认为可能与脑梗死发病风险增加有关。急性脑梗死发生后,基质金属蛋白酶-9在缺血脑组织和外周血的表达水平增高,病理性破坏血脑屏障,加重脑水肿与神经损伤,也与随后发生的出血转化、缺血再灌注损伤存在密切联系。动物实验证实,在急性期通过抑制剂、基因敲除等方式能够减少脑梗死损伤。