奶牛乳房炎相关IRF5基因CDS区克隆及表达分析

作者：闫涛涛; 姚婷婷; 王正兴; 马楠; 蓝贤勇; 周力; 王兴平; 罗仍卓么^*

来源：西南农业学报, 2023, 36(05): 1097-1104.

DOI：10.16213/j.cnki.scjas.2023.5.024

• 奶牛
• 乳房炎
• IRF5基因
• 生物信息学分析
• 基因表达
• 乳腺上皮细胞

【目的】研究奶牛干扰素调节因子5(Interferon regulatory factor 5,IRF5)基因在奶牛乳腺组织及乳腺上皮细胞炎症中的表达模式。【方法】利用RT-PCR和测序技术克隆得到IRF5基因的编码区(Coding sequence, CDS)序列，并采用生物信息学方法分析IRF5基因及其特性；利用qPCR技术检测IRF5基因及相关干扰素调节因子3(Interferon regulatory factor 3,IRF3)和MyD88基因的表达量。【结果】IRF5基因的CDS长度为1500 bp,编码499个氨基酸，存在47个潜在磷酸化位点，氨基酸组成中脯氨酸(Pro)和亮氨酸(Leu)所占比例较高。IRF5蛋白分子式为C2524H3901N671O728S20,主要存在于细胞核和线粒体，理论等电点为5.38,是碱性亲水且不稳定的非分泌蛋白。蛋白互作分析结果显示，IRF5蛋白可能与骨髓分化初级反应蛋白(MyD88)、白细胞介素-1受体相关激酶1(IRAK1)、C-C基序趋化因子4(CCL4)、组蛋白乙酰转移酶p300(EP300)和核受体共激活因子3异构体X1(NCOA3)等蛋白相互作用，与机体或细胞的炎症反应有关。qPCR结果表明，与健康奶牛相比，IRF5基因在乳房炎奶牛的乳腺组织中的表达量极显著上调(P<0.01)。在乳腺上皮细胞中，与对照组(0 h)相比，IRF5及其相关的Myd88和IRF3基因在LPS诱导乳腺上皮细胞炎症反应的3、6和12 h的表达量均极显著上调(P<0.01)。【结论】IRF5基因在奶牛乳房炎过程中表达量上调，可能通过上述基因参与促进奶牛乳房炎症反应。

• 单位
  西北农林科技大学; 动物科技学院; 宁夏大学