摘要

目的 应用生物信息学方法探究POLD1基因在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC中的表达及临床意义。方法 应用TIMER数据库分析POLD1在NSCLC及正常肺组织中的表达差异,UALCAN数据库进一步验证并分析POLD1在不同临床亚组间的表达。利用GEPIA、TIMER数据库探索POLD1表达水平与NSCLC患者预后的关系,cBioPortal、STRING数据库研究POLD1在NSCLC中突变及蛋白相互作用,TISIDB数据库探索POLD1表达与NSCLC肿瘤免疫浸润的关系。结果 POLD1在肺腺癌及肺鳞癌组织中表达均高于正常组织。POLD1低表达的肺腺癌患者较高表达患者预后更好,POLD1与肺鳞癌患者预后无明显相关性。突变分析发现1.2%的肺腺癌患者及1.8%的肺鳞癌患者携带POLD1突变,主要为错义突变。蛋白互作分析发现POLD1可能与POLD2、POLD3、POLD4、POLE、RPA1、PCNA、MSH6、MSH2、FEN1蛋白有相互作用,功能集中于DNA复制、错配修复等。此外,POLD1与NSCLC组织中免疫细胞浸润相关。结论 POLD1在NSCLC中高表达,其表达与肺腺癌生存预后呈负相关。POLD1基因可能成为NSCLC早期诊断、预后判断及免疫疗效标志物。

  • 单位
    南京医科大学第一附属医院