科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
目的：利用生物信息学方法对女性肺腺癌肿瘤组织及正常组织的差异表达基因进行筛选及分析，筛选出女性肺腺癌发生发展的关键基因，并为后续研究提供候选基因。方法：从GEO数据库中下载肺腺癌基因芯片数据集GSE19804、GSE40791、GSE31210、GSE7670、GSE10072、GSE32863、GSE75037，利用在线工具GEO2R筛选出数据集中正常女性肺组织和女性肺腺癌组织的差异表达基因（DEGs），然后利用DAVID数据库对DEGs进行GO和KEGG富集分析，接着利用STRING和Cytoscape软件构建蛋白互相网络（PPI）并筛选出Hub基因，并利用oncomine、UALCAN数据库进行验证，最后使用Kaplan-Meier plotter数据库对筛选出的Hub基因进行生存分析。结果：在7个数据集中共筛选出276个DEGs，其中69个上调，207个下调。共筛选出CDC20、CENPF、KIAA0101、TOP2A、ASPM、TYMS、MCM4、NUSAP1、MELK、UBE2C等10个Hub基因，Kaplan-Meier生存分析显示除ASPM外，其余9个均与女性肺腺癌的总体生存率相关。结论：最终筛选出的10个Hub基因可能与女性肺腺癌的发生发展密切相关，其可能是女性肺腺癌发病机制、预后判断和治疗研究的新靶点。
-
单位十堰市太和医院; 湖北医药学院
