基于基因组学数据分析构建肾上腺皮质癌预后模型

作者：朱菡; 方小满^*

来源：成都医学院学报, 2021, 16(02): 221-225.

• 肾上腺皮质癌
• 基因组学
• 列线图
• 预后模型

目的通过对基因组学数据进行分析,筛选肾上腺皮质癌(ACC)预后相关独立危险因素,并构建ACC预后相关的列线图模型。方法从GEO数据库下载GSE10927数据集数据,利用一系列生物信息学方法,对GSE10927数据集进行处理、分析,并筛选差异基因。通过单因素与多因素的Cox回归分析,筛选与ACC患者预后相关的独立危险因素。使用GEPIA在线分析工具及TCGA数据库数据对上述发现的独立危险因素进行验证。最后,通过R软件构建和验证ACC预后相关列线图模型。结果从GSE10927数据集中获得12个仅在ACC患者中明显差异表达的基因。经过单因素与多因素的Cox回归分析表明,CDK1、PBK、KIAA0101和PRC1可作为ACC患者的预后相关独立危险因素。经过GEPIA在线分析工具及TCGA数据库数据的验证,再次证实CDK1、PBK、KIAA0101和PRC1可作为ACC患者的预后相关独立危险因素。利用上述独立危险因素构建列线图模型,该模型对ACC患者1、3、5年生存率预测性能的AUC值分别为[0.83,95%CI(0.68～0.99)]、[0.89,95%CI(0.82～0.96)]、[0.81,95%CI(0.69～0.92)]。结论 CDK1、PBK、KIAA0101和PRC1基因是ACC患者预后相关的独立危险因素,同时有望成为ACC靶向治疗的新靶标。本研究基于基因组学数据分析所构建的列线图模型,可有效预测ACC患者1、3、5年的生存状况。

• 单位
  重庆市大足区人民医院