创新多样性是区域创新系统自我调节能力的基础和重要特征,对维持区域创新生态系统稳定性具有重要作用。自然生态系统与区域创新生态系统无论从概念上还是方法论上存在着诸多相似性,生态学的生物多样性理论能够为区域创新多样性研究提供依据。通过梳理区域创新生态系统研究历程,并基于生物多样性理论,采用类比方法探讨了区域创新多样性概念层次,即知识及技术多样性、主体多样性、创新生态系统多样性3个层次,初步揭示了3个层次在系统中的作用及其之间的相互关系。