葡萄VvWRKY70基因生物信息学及表达特性分析

作者：李晋圆; 李莉娟; 宋晶晶; 闫冬梅; 董志刚; 仪慧兰^*

来源：山西农业科学, 2023, 51(09): 1034-1041.

• 葡萄
• VvWRKY70
• 生物信息学
• 转录特征

WRKY是植物特有的转录因子，在多种生物和非生物胁迫中发挥作用。基于RNA-seq技术，课题组前期研究发现，SO2熏蒸结合低温保鲜过程中多个功能未知的葡萄WRKY基因差异表达。经氨基酸序列同源性比对，研究选择与AtWRKY70氨基酸序列相似度最高的VvWRKY70进行生物信息学及表达特性分析。生物信息学分析结果表明，VvWRKY70基因启动子区含有W-box元件及茉莉酸甲酯、水杨酸等激素响应元件；编码蛋白由322个氨基酸组成，分子质量约36.57 ku，属亲水性蛋白；该蛋白丝/苏氨酸含量丰富；二级结构主要由无规卷曲和α-螺旋组成，N端含有高度保守的WRKY结构域，C端为C2HC型锌指结构，属WRKY第Ⅲ亚家族；预测显示，其主要定位于细胞核中，且在进化上较为保守。qRT-PCR分析表明，VvWRKY70在玫瑰香葡萄根、茎、叶、花蕾、果中均有表达；葡萄果实VvWRKY70受SO2和灰霉菌诱导上调表达，低温处理组下调表达。综上可见，VvWRKY70可能作为转录因子参与调节植株生理和果实发育过程，并在葡萄果实采后SO2保鲜过程中发挥作用，调节果实贮藏期间的生物和非生物胁迫应答。

• 单位
  生命科学学院; 山西农业大学; 山西大学