一株H9N9亚型禽流感病毒的全基因组测序与遗传进化分析

作者：杨岑; 李玉磊; 李**; 刘丽娜; 郝丽; 王亚君^*; 李雁冰^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2021, (23): 1-17.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2021.04.0326

• 禽流感病毒
• H9N9亚型
• H9N2亚型
• 遗传进化
• 核苷酸同源性

为了了解从广西地区有流感症状的病鸡中分离出的低致病性禽流感病毒(LPAIV)CK/GX/C283/2013(H9N9)的生物学特性,试验对该毒株进行了病毒的纯化、PCR扩增和测序,以及关键氨基酸位点和全基因组的遗传进化分析。结果表明:CK/GX/C283/2013(H9N9)毒株的外部基因HA、NA和内部基因PB2、PB1、PA、NP、M和NS基因长度分别为1 683,1 398,2 280,2 274,2 151,1 497,982,844 bp。CK/GX/C283/2013(H9N9)毒株与H7N9及H9N2亚型AIV的核苷酸序列有较高同源性,为98.99%～99.88%;内部基因与H5N1、H5N6、H10N6和H10N8等亚型AIV核苷酸序列同源性也较高,为97.66%～99.64%。CK/GX/C283/2013(H9N9)毒株的HA蛋白裂解位点基序为330PSRSSR↓GL340,与LPAIV氨基酸序列特征符合;HA蛋白氨基酸的第226位点由Q突变为L,使其与人源α2,6受体的结合能力增强;M2蛋白氨基酸的第31位点发生了突变,由S突变为N。CK/GX/C283/2013(H9N9)毒株的外部基因HA位于Y280-Like分支上,NA基因与A/Nanjing/6/2013(H7N9)毒株的遗传距离较近,属于Group 3分组。CK/GX/C283/2013(H9N9)毒株的内部基因PB2、PB1、PA、NP、NS和M分别与A/Chicken/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013(H7N9)、A/Chicken/Wuxi/0405005/2013(H7N9)、A/Chicken/Zhejiang/C483/2013(H7N9)、A/Pigeon/Jiangsu/K23/2013(H9N2)、A/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013(H7N9)和A/Shanghai/4664T/2013(H7N9)毒株的遗传距离最近。说明CK/GX/C283/2013(H9N9)毒株是H7N9亚型和H9N2亚型的重组毒株,H9N9亚型AIV内部基因来源十分复杂,与H10N8、H5N6、H5N1、H7N9、H10N6和H9N2亚型AIV间都可能存在基因重组现象。

• 单位
  东北林业大学; 兽医生物技术国家重点实验室; 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所