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摘要
【目的】了解云南省德宏州陇川县蚕区家蚕核型多角体病毒(BmNPV)株系的遗传地位和多样性，为厘清云南蚕区BmNPV的起源及科学防控家蚕血液型脓病提供参考依据。【方法】对分离自云南省德宏州陇川县蚕区的BmNPV进行lef-8基因克隆，通过ExPASy、SignalP 5.0、TMHMM 2.0、NetOGlyc 4.0、NetPhos 2.0及SWISS-MODEL等在线软件进行生物信息学分析，并基于lef-8基因核苷酸序列相似性，采用MEGA7.0中的邻接法(NJ)构建系统发育进化树。【结果】云南省德宏州陇川县蚕区BmNPV-YNLC株的lef-8基因序列全长2631 bp，共编码876个氨基酸残基；其编码蛋白(LEF-8)无信号肽序列，也不存在跨膜结构域，蛋白分子量为101.63 kD，理论等电点(pI)为8.8；在第750～800位氨基酸残基区域具有较高的疏水性，部分氨基酸位点表现为亲水性，且具有较高抗原指数和表面可及性；存在6个潜在的N-糖基化位点，62个磷酸化位点(25个丝氨酸磷酸化位点，23个苏氨酸酸化位点，14个酪氨酸磷酸化位点)，但不存在O-糖基化位点。BmNPV-YNLC株与BmNPV-T3株的lef-8基因核苷酸序列相似性为99.7%,BmNPV-YNLC株lef-8基因在第96～98位核苷酸序列上存在3个碱基(CAA)缺失；此外，还存在2个非同义突变(646T→A和1895C→G)和7个同义突变。基于lef-8基因核苷酸序列相似性构建的系统发育进化树显示，BmNPV-YNLC株与日本和韩国地区的BmNPV亲缘关系较近，而与我国流行的BmNPV遗传关系较远。【结论】lef-8基因在不同地区来源的BmNPV株系中高度保守，BmNPV-YNLC株与日本和韩国地区的BmNPV亲缘关系较近，但其LEF-8蛋白N端存在氨基酸缺失突变，说明BmNPV-YNLC株为云南蚕区的新流行株系。
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