两种诱变处理下紫花苜蓿全基因组DNA甲基化图谱分析

作者：申晓慧

来源：草地学报, 2022, 30(01): 46-54.

• 紫花苜蓿
• DNA甲基化
• 重亚硫酸盐测序
• 表观遗传

为了探究不同诱变处理对紫花苜蓿表观遗传学效应的影响,试验采用甲基磺酸乙酯(EMS)和60CO-γ两种诱变方法对紫花苜蓿种子进行处理,采用重亚硫酸盐测序(BS-seq)技术,对紫花苜蓿诱变前后全基因组DNA甲基化图谱进行分析。结果表明,紫花苜蓿体内的DNA甲基化主要有mCG,mCHH和mCHG 3种类型;C位点发生甲基化的比率在EMS诱变处理下表现为上升,在60CO-γ诱变处理下表现为下降。此外,DNA甲基化主要发生在CG序列;对不同诱变处理组的差异甲基化区域(DMR)鉴定发现有105个基因在两组比较中均存在DMR,KEGG通路富集分析表明,在DMR相关基因中显著富集的通路主要包括氮代谢通路(Nitrogen metabolism)、淀粉和蔗糖代谢途径(Starch and sucrose metabolism)、脯氨酸代谢(Proline metabolism)等生物学过程。因此,诱变改变了苜蓿DNA甲基化水平,为诱变突变体的筛选提供了丰富材料。

• 单位
  宜春学院; 生命科学与资源环境学院