脐带间充质干细胞治疗乳腺癌核心靶点的预测

作者：尤斯涵; 郭春燕^*

来源：神经药理学报, 2021, 11(06): 17-24.

• 脐带间充质干细胞
• 乳腺癌
• 网络药理学
• 生物信息学

目的：利用网络数据库和生物信息学技术平台，分析脐带间充质干细胞（umbilical cord mesenchymal stem cells,UC-MSCs）治疗乳腺癌疾病（breast cancer,BC）的数据，预测UC-MSCs治疗乳腺癌的核心靶点。方法：从NCBI(www.ncbi.com.cn)中的GEO数据库搜索UC-MSCs治疗BC的原始数据集GSE64827，利用R软件对其数据进行标准化处理得出差异基因。使用STRING数据库进行蛋白-蛋白相互作用网络分析和拓扑分析，利用DAVID在线工具和R软件对相关基因进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果：利用R软件筛出11个差异基因，做其蛋白-蛋白相互作用（置信度大于或等于0.7的相关基因）网络分析和拓扑分析，提示ALDOC、IGFBP3、DDIT4和PFKFB4这4个基因的关联度较高。GO分析注释得到了3条生物过程，分别是果糖代谢过程、糖酵解过程和缺氧反应过程，涉及的主要基因为PFKFB4、ALDOC、DDIT4和CA9。KEGG通路分析得到一条果糖和甘露糖代谢通路，涉及基因为ALDOC、PFKFB4。结论：本研究利用网络数据库和生物信息学技术平台预测UC-MSCs治疗乳腺癌核心靶点有ALDOC、PFKFB4和DDIT4。

• 单位
  河北北方学院