宏基因组二代测序对肾脏重症监护病房免疫功能低下患者感染的诊断价值

作者：李喆; 蒋静; 王杨; 周玉超; 余乐; 娄丽璇; 许书添; 李世军^*

来源：肾脏病与透析肾移植杂志, 2022, 31(05): 407-413.

• 慢性肾脏病
• 免疫缺陷
• 感染病学
• 宏基因组二代测序技术

目的：回顾性分析宏基因组二代测序(mNGS)对肾脏重症监护病房(ICU)免疫功能低下患者感染的诊断价值，评估临床应用前景。方法：选取2018年8月至2022年4月国家肾脏疾病临床医学研究中心ICU收治疑诊感染的慢性肾脏病(CKD)免疫功能低下患者，分为常规微生物学检测(CMT)确诊感染组、临床诊断感染组和排除感染组，对比mNGS与CMT的诊断效能。结果：本研究共纳入303例患者，累计使用2(1, 3)种免疫抑制剂，中位治疗时间7(2, 50)月，中位CD4+T细胞计数149.50(81.25, 262.25)个/μL,在院死亡率20.46%。CMT确诊感染组中38.79%的mNGS与CMT结果完全一致，27.88%部分一致，33.33%不一致。临床诊断感染组中57.69%通过mNGS发现感染病原体。mNGS报阳时间更早，检测病原体种类更多(P<0.05),混合感染检出率高(P<0.001),可鉴定出常规培养难以发现的病原体。mNGS对感染病原体检测灵敏度和准确度强于CMT(P=0.014),特异度、阳性及阴性预测值无明显差异。结论：mNGS能增加免疫功能低下的CKD患者感染病原体检测的灵敏度和准确度，缩短报阳时间，提高混合感染、机会性感染、罕见感染病原体检出率。