低密度cDNA芯片技术的优化

作者：赵雨杰; 黄宝俊; 徐惠绵; 何群

来源：生命科学研究, 2004, (04): 322-328.

DOI：10.16605/j.cnki.1007-7847.2004.04.006

• cDNA芯片
• 靶基因长度和浓度
• 点样溶液
• 杂交动力学
• 可靠性

为了建立稳定的低密度cDNA芯片技术平台,研究靶基因的最适长度、浓度、点样溶液种类及杂交反应动力学,并了解该芯片的重复性与可靠性.结果表明,杂交具有较好的特异性,不同长度(189～1078bp)、浓度(0.5g/L、1.0g/L、1.5g/L)的同一靶基因杂交信号强度无明显差别;以50%DMSO为点样溶液者杂交信号最好(P=0.0001).60℃杂交18h信号最佳(P<0.001).重复2次检测结果差异无显著性(P=0.348),重复性较好,其相关系数为0.588.与RT-PCR结果相比,相关系数为-0.778(P<0.0001),特异性为100%,灵敏度为80%(16/20),可靠性较好.

• 单位
  辽宁沈阳; 中国医科大学附属第一医院; 中国医科大学