2009～2012年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA与NA基因的进化分析

作者：吴英萍; 崔大伟; 秦志梅; 谢国良; 杨先知; 郑书发; 余斐; 范剑; 陈瑜

来源：临床检验杂志, 2013, 31(04): 272-275.

DOI：10.13602/j.cnki.jcls.2013.04.001

• 甲型H1N1流感病毒
• 血凝素
• 神经氨酸酶
• 建模

目的研究杭州地区2009年至2012年甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)与神经氨酸酶(NA)的基因进化特征,分析该病毒的遗传变异和抗原的分子水平转变。方法用RT-PCR分别扩增甲型H1N1流感病毒HA基因和NA基因片段并进行测序,用DNAMAN和MEGA 4.0生物信息学软件对HA和NA基因序列进行进化分析。结果建立的RT-PCR可成功检测HA(C)、HA(D)和NA基因,遗传进化分析结果表明,杭州地区甲型H1N1流感病毒的HA与NA氨基酸序列的亲缘系数与WHO推荐的病毒株及国内代表株的同源性均为98.9%～100%;三维构象结果表明,HA编码的蛋白质有5个位点发生改变,而NA编码的蛋白质仅发生2个位点改变。结论 2009年至2011年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA和NA基因序列与世界范围内流行的病毒参考株具有高度同源性,但HA与NA蛋白质表位存在某些氨基酸位点的改变。

• 单位
  浙江大学医学院附属义乌医院; 浙江大学医学院附属第一医院