葡萄幼叶环状RNA(CircRNA)的鉴定与分析

作者：陈迎春; 吴新颖; 蒋锡龙; 张倩倩; 李益; 慕茜; 杨立英; 王咏梅; 张加魁^*; 王鹏飞^*

来源：中外葡萄与葡萄酒, 2018, (06): 32-38.

DOI：10.13414/j.cnki.zwpp.2018.06.006

• 葡萄
• 幼叶
• 环状RNA
• miRNA
• 靶基因

本研究以‘赤霞珠’葡萄幼叶为试材,构建环状RNA测序文库并鉴定了1172个环状RNA。结果表明,这些环状RNA的来源基因涉及多种功能,包括抗逆、抗病、发育等,并且这些环状RNA中有74个可以结合73种葡萄miRNA,而大部分不能结合miRNA。这73种可以结合环状RNA的葡萄miRNA共靶向710个靶基因。很多涉及的miRNA都对应了个10以上靶基因。比较了靶基因和环状RNA来源基因,发现有很多功能类似,但是也有很多不同的功能。GO分析显示二者最富集的条目都是细胞、细胞部分、细胞器、催化活性及绑定。但是二者被注释的条目种类差别很大。说明葡萄环状RNA来源于不同种类的基因,且可能调控多种基因。

• 单位
  农业部