假单胞菌单基因甲基化位点的检测与自发表型变异分析

作者：叶惠闽; 黄显清; 张雪洪^*

来源：实验室研究与探索, 2021, 40(04): 38-42.

DOI：10.19927/j.cnki.syyt.2021.04.009

• DNA甲基化
• 重亚硫酸盐测序
• 绿针假单胞菌
• 表型突变株

重亚硫酸盐测序(BSP)技术是一种广泛应用的DNA甲基化检测技术,其检测分辨率达到单碱基水平,可用于短片段的高精度测序。利用BSP技术对DNA水平上不存在差异的绿针假单胞菌HT66及其荧光表型突变株HT66-FLUO的同一基因片段gacS并行测定,发现HT66-FLUO的gacS中存在2个甲基化位点,甲基化率分别为50%和100%,确定全局性调控基因gacS发生了甲基化修饰,从而影响了gacS的功能,导致HT66-FLUO自发表型变异。研究表明,BSP检测方法可应用于细菌单基因的甲基化位点分析,为细菌甲基化研究提供借鉴。

• 单位
  上海交通大学; 生命科学技术学院; 微生物代谢国家重点实验室