摘要
本研究运用网络药理学与分子对接技术探讨山苦茶治疗神经退行性疾病(neurodegenerative diseases, NDs)的分子机制,为山苦茶的应用提供理论依据及研究思路。通过检索文献查找山苦茶的活性成分,利用PubChem及SwissTargetPrediction数据库获取山苦茶活性成分的靶点基因;利用GeneCards与Disgenet数据库获取与NDs相关的疾病基因,并与山苦茶的基因取交集获得共有基因。利用DAVID 2023在线数据库对共有靶点进行基因本体(GO)和信号通路(KEGG)富集分析,应用STRING11.5在线数据库构建共有靶点蛋白互作网络(PPI)。运用AutoDock vina1.5.6软件对山苦茶主要活性成分(配体)与核心靶点蛋白(受体)进行分子对接,再利用PyMol软件将其结果进行可视化处理。经文献筛选得出山苦茶主要活性成分17个,对应靶点基因337个;NDs的靶点基因2593个。药物与疾病取交集得到168个共有靶点,其中核心靶点有25个,包括AKT1、IL6、SRC等。GO富集分析结果显示,山苦茶-NDs的交集基因的生物学功能主要富集到基因表达的正向调控等,细胞组成主要富集到等离子体膜与胞质中,分子功能主要富集到RNA聚合酶II转录因子活性等。KEGG通路富集结果显示,交集基因主要分布在PI3K-AKT等信号通路上。分子对接结果显示山苦茶的核心成分与治疗NDs的靶点可自由结合。本研究初步探索了山苦茶有效活性成分治疗NDs的作用机制,为山苦茶的开发利用提供理论依据。
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