适用于转录组测序的毛葡萄叶片总RNA提取方法筛选

作者：张树伟; 丁峰; 黄羽; 彭宏祥^*; 卢江^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(11): 3593-3597.

DOI：10.13271/j.mpb.018.003593

• 毛葡萄(Vitis quinquangularis)
• 叶片
• RNA提取方法
• 转录组测序

毛葡萄叶片中含有大量多糖、多酚等多种次生代谢物,严重影响RNA提取质量,筛选从毛葡萄叶片中提取高质量RNA的方法是开展相关分子研究的基础。本研究采用改良CTAB法、改良SDS/酚法和三种试剂盒法,筛选适合转录组测序的提取毛葡萄叶片总RNA的方法。结果显示,五种方法均可以获得毛葡萄叶片总RNA,但在纯度和完整性上差别较大。改良CTAB和改良SDS/酚法提取的总RNA OD260/OD230比值小于1.8,试剂盒A法提取的总RNA在纯度和完整性上均可以满足转录组测序要求,试剂盒B法和试剂盒C法提取的总RNA降解严重。相比其他四种方法,试剂盒A法提取的毛葡萄叶总RNA质量更好,在纯度和完整性上均能满足转录组测序及其他分子生物学实验的要求。

• 单位
  广西农业科学院园艺研究所; 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室; 广西壮族自治区农业科学院葡萄与葡萄酒研究所