梨萜类合成酶基因家族生物信息学与表达模式分析

作者：赵荣荣; 刘斌; 郭超; 刘恒; 张元湖

来源：生物技术通报, 2018, 34(05): 131-141.

DOI：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-0804

• 梨
• 萜类合成酶
• TPS基因家族
• 生物信息学
• 表达分析

萜类合成酶(Terpene synthases,TPS)是萜类化合物合成过程中的关键酶。基于梨(Pyrus bretschneideri)全基因组数据库,采用生物信息学和分子生物学方法,对梨TPS基因家族进行鉴定和亚家族分类,研究梨TPS基因的结构及编码蛋白质性质和表达模式。共鉴定获得33个萜类合成酶基因家族成员,聚类为5个亚家族,其中,TPS-a亚家族成员数量最多,包含4-7个外显子;主要定位于细胞质,少数分布在线粒体、叶绿体和内质网等;梨TPS蛋白均为亲水性蛋白,α-螺旋和无规卷曲是其二级结构主要组成元件,β-折叠和延伸链散布其中;TPS-a中保守基序个数相对较多,TPS-e/f相对较少;各亚族内蛋白质在三级结构上高度相似。除PbrTPS24外,其余9个TPS基因在根、茎、幼叶和幼芽中均有表达,并且不同的基因在不同部位高表达,PbrTPS存在组织特异性表达。

• 单位
  作物生物学国家重点实验室; 山东农业大学