赤水乌骨鸡ExFABP基因序列生物信息学及组织表达分析

作者：吴芸^*; 欧正淼; 李秋玉; 陈粉粉; 闫吉美

来源：中国畜牧杂志, 2023, 59(12): 161-165.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20221024-01

• 赤水乌骨鸡
• ExFABP基因
• 生物信息学分析
• 组织表达

本研究旨在对赤水乌骨鸡的ExFABP基因编码区（Coding Sequence,CDS）序列进行测序及生物信息学分析，检测其在不同组织中的表达，探究ExFABP对赤水乌骨鸡肉质性能的影响。运用RT-PCR对赤水乌骨鸡ExFABP基因的编码区序列进行扩增测序，并对其氨基酸序列进行生物学特性分析，构建物种进化树揭示亲缘关系，同时通过实时荧光定量PCR检测了赤水乌骨鸡不同组织中ExFABP的差异表达情况。结果显示，赤水乌骨鸡ExFABP基因编码区长537 bp，编码178个氨基酸。赤水乌骨鸡ExFABP编码氨基酸序列与原鸡的同源性最高，达到100%。系统进化树分析表明，赤水乌骨鸡与原鸡的亲缘关系最近。ExFABP基因在各组织中均有表达，在肺脏中的表达量最高，显著高于其他组织，在胸肌中的表达量最低。研究结果为进一步研究改善赤水乌骨鸡肉品质、风味提供基础材料。

• 单位
  西南林业大学; 遵义师范学院; 生命科学学院