用于苹果树病毒鉴定的small RNA深度测序数据集

作者：胡国君; 董雅凤^*; 张尊平; 范旭东; 任芳

来源：农业大数据学报, 2022, 4(02): 25-29.

DOI：10.19788/j.issn.2096-6369.220204

• 苹果
• 病毒
• 鉴定
• small RNA测序
• 生物信息学

病毒病是为害苹果的重要致病因子，开展病毒种类鉴定是防控苹果病毒病的首要任务。由于苹果长期通过嫁接的方式进行繁育，导致树体感染多种病毒，加之苹果病毒的浓度较低，序列变异较大，致使苹果病毒种类的鉴定尤为困难。此外，现有的分子检测技术主要为聚合酶链式反应和分子杂交技术，这些技术基于已知病毒核苷酸序列为基础开展鉴定，而对于未知病毒，由于其核苷酸序列尚未测定，则无法采用这些分子技术进行鉴定。针对这一瓶颈，该文提供了一个自然生长的苹果树的small RNA (sRNA)深度测序的数据集，通过结合生物信息学方法对原始数据进行过滤、sRNA组装及Blast比对，可准确地分析和判断自然条件下病毒的种类，为苹果病毒的鉴定带来了新的突破，同时也为苹果无毒苗木的判定提供技术支撑。

• 单位
  中国农业科学院果树研究所