《全元文》的编修促进了元代文史研究,但因收录文献范围广,疏失在所难免。从地方志及元人著作集中辑补乔思庸《赵城县重修庙学记》、王思诚《重修晋祠记》、帖陆迩补花《重修祝融庙记》、赵《改正翼城县缪事》、周伯琦《通鉴续编序》、陈桱《通鉴续编自序》、赵贽《贡礼部玩斋文集序》、钱用壬《玩斋诗集序》、谢肃《贡礼部玩斋文集序》共9篇《全元文》失收、讹漏元文,略作整理、疏证。