不明原因发热患者肺泡灌洗液病毒群落解析

作者：李欣霖; 刘齐; 陈旭; 肖宇晴; 杨世兴; 张文; ***^*

来源：江苏大学学报(医学版), 2020, 30(05): 395-401.

DOI：10.13312/j.issn.1671-7783.y200051

• 肺泡灌洗液
• 病毒宏基因组学
• 细环病毒
• 鼻病毒
• 系统进化分析

目的:分析不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒谱。方法:将58例肺泡灌洗液样本随机分为5组分别构建5个文库,利用病毒宏基因组学技术进行病毒群落分析,并对获得的细环病毒及鼻病毒进行阳性样本筛选。结果:肺泡灌洗液病毒群落组成中,指环病毒科占主体地位(19.4%),其次为圆环病毒科(11.0%),藻去氧核糖核酸病毒科(11.0%),人类内源性递转录病毒科(10.2%),痘病毒科(4.9%),逆转录病毒科(3.2%),帚状病毒科(2.3%),小RNA病毒科(0.6%);并发现了4株序列较长的细环病毒,根据细环病毒开放阅读框1进行系统进化分析,显示其与已知的细环病毒在核酸水平上有一定的差异。通过对细环病毒及鼻病毒阳性样本的筛选,发现细环病毒阳性率为11.3%,鼻病毒阳性率为10.0%。结论:应用病毒宏基因组学技术成功解析出不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒群落组成,病毒群落中指环病毒科占比最高,其中细环病毒因发热导致的炎性环境以及患者免疫力低下而大量增殖。

• 单位
  江苏大学附属人民医院; 江苏大学