安卡拉病毒贵州分离株Fiber2基因的克隆及序列分析

作者：方天; 何玲; 尹德晶; 岳筠; 朱二鹏; 文明; 程振涛^*

来源：江苏农业学报, 2022, 38(06): 1603-1611.

• 禽腺病毒血清4型
• Fiber2基因
• 生物信息学分析

Fiber2蛋白是禽腺病毒血清4型(FAdV-4,又称安卡拉病毒)重要的免疫原蛋白，为深入了解FAdV-4贵州株Fiber2基因的遗传变异情况，本研究利用PCR技术扩增FAdV-4贵州晴隆株(GZ-QL)Fiber2基因，胶回收后将其连接至pMD19-T载体，转化入DH5α筛选阳性克隆质粒，经质粒PCR及双酶切鉴定后进行DNA测序，然后对测序结果进行生物信息学分析。结果显示，GZ-QL株Fiber2基因全长为1 440 bp,与四川分离的SCnj1601强毒株、北京分离的NIVD2强毒株Fiber2基因核苷酸同源性均为100.0%,与FAdV-4经典ON1株Fiber2基因核苷酸同源性为95.9%,两者位于相同进化分支。GZ-QL Fiber2蛋白共有33个氨基酸突变位点，其中，在第11～15位之间有5个氨基酸插入；蛋白质亲水性平均值为-0.031,其二级结构以无规则卷曲为主(占51.8%),无跨膜结构域或信号肽，抗原表位分布均匀，预测有8个优势抗原表位区域，且集中于N端。以上结果表明，FAdV-4贵州株GZ-QL Fiber2蛋白在禽腺病毒血清4型内相对保守且抗原性良好，具备成为优势抗原的潜力。

• 单位
  动物科学学院; 贵州大学