2014年《国务院关于批转财政部权责发生制政府综合财务报告制度改革方案的通知》(国发[2014]63号)中要求,到2020年全面开展政府财务报告编制工作,建立健全政府财务报告分析应用体系。教育部直属高校2019年启动政府部门财务报告编制工作,工作自开展以来,,取得一些成效和经验,但也存在仍需改进的地方。本文总结高校编制政府部门财务报告中遇到的问题,探索问题的解决途径,以期提高高校政府部门财务报告编制的质量和效率。