溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统vscP基因的克隆与生物信息学分析

作者：李静; 庞欢瑛; 简纪常; 鲁义善; 汤菊芬; 吴灶和

来源：广东海洋大学学报, 2016, (04): 30-36.

• 溶藻弧菌
• Ⅲ型分泌系统
• 基因克隆
• 生物信息学分析
• vscP Vibrio alginolyticus
• type 3 secretion system
• gene cloning
• bioinformatics analysis
• vscP

根据NCBI上登录的溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)全基因组序列,设计一对克隆溶藻弧菌HY9901株Ⅲ型分泌系统"分子尺"蛋白VscP全长基因的特异性引物,PCR扩增获得基因的全长片段。结果显示,vsc P(Gen Bank登录号FR780678)开放阅读框ORF为1 206 bp,共编码401个氨基酸残基。根据推导的氨基酸序列预测其分子质量约为44.4 ku,等电点为5.72。Signal 4.1 Server和TMHMM Server 2.0预测结果表明,VscP无信号肽与跨膜结构域。Soft Berry-Psite预测结果显示,VscP含有3个N端糖基化位点,2个cA...

• 单位
  广东省教育厅; 仲恺农业工程学院; 广东海洋大学