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摘要
基因表达是生物体中最重要和最基础的生物学过程和分子活动,生物体正是通过调控不同基因表达而实现生长发育和抵御刺激等生命活动.转录组测序是目前在生物医学研究中应用最为广泛的高通量检测基因表达的技术,也促进了大量针对转录组数据的生物信息挖掘方法和工具的发展.本文就基因表达中的转录组数据分析和挖掘方法进行了综述,从已有大规模转录组数据资源、转录组数据的常规分析、癌症转录组分析、转录组新技术和分析等生物信息方法方面进行了总结;同时,阐述了基于转录组数据的疾病标志物发现和分类预测模型研究方法,对正在兴起和迅速发展的单细胞转录组和空间转录组及其分析方法也进行了介绍;最后,总结了转录组测序适用的研究问题和分析内容及工具.本文将有助于广大生物医学研究者快速了解转录组技术的分析内容和适用情况,为选择合适的转录组测序和分析方法提供参考.
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