羟自由基调控血管平滑肌细胞蛋白变化的生物信息学研究

作者：沙芳芳; 余晓雪; 张欣欣; 周亚宁; 石科^*; 范沛^*

来源：河南医学高等专科学校学报, 2023, 35(01): 1-9.

• 羟自由基
• 血管平滑肌细胞
• 差异表达蛋白
• 生物信息学分析

目的 通过对羟自由基(·OH)诱导血管平滑肌细胞差异表达蛋白的系统生物信息学分析，探讨·OH调控血管平滑肌细胞的相关分子机制。方法 对485个差异表达蛋白(337个上调和148个下调蛋白)进行功能和通路富集、亚细胞定位预测、蛋白-蛋白互作(PPI)和信号网络构建，以及基因-miRNA、转录因子-基因和蛋白-化学品互作分析。结果 ·OH诱导的血管平滑肌细胞差异表达蛋白显著富集在一系列细胞核和细胞质中及与蛋白质活动有关的通路上；在PPI网络中，连环蛋白β1、组蛋白脱乙酰酶1和部分核糖体、蛋白酶体蛋白可能是·OH调控的关键节点蛋白。此外，发掘出一批miRNA(例如mir-181a-5p)、转录因子(例如上游结合转录因子)和化学品(例如四氯二苯二氧芑),亦可能参与·OH对血管平滑肌细胞的调控。结论 预测·OH可调控多种分子，影响血管平滑肌细胞功能。

• 单位
  生物工程学院; 河南医学高等专科学校; 河南工业大学