建设项目跟踪审计是区别于传统事后审计的一种科学的审计模式。阐述跟踪审计在建设项目审计中存在的主要问题,结合高校工程管理实践,从跟踪审计的预警机制、权力监督、绩效考核等方面提出一些建议,为提高高校基本建设项目跟踪审计质量和效益提供借鉴。