基于铁死亡相关基因标签的肝细胞癌预后风险评估模型的建立

作者：王静; 丁鹏鹏; 李莉; 王亚丹; 郭春梅; 林琳; 王沧海; 刘红

来源：胃肠病学和肝病学杂志, 2023, 32(03): 295-300.

DOI：10.3969/j.issn.1006-5709.2023.03.011

• 肝细胞癌
• 铁死亡
• TCGA数据库
• 预后风险
• 预测模型

目的 通过对TCGA测序数据库的挖掘，筛选肝细胞癌(hepatocellular carainoma, HCC)预后相关铁死亡基因并构建Signature预后风险评估模型。方法 从TCGA数据库获取HCC测序数据，采用R语言进行铁死亡相关基因表达差异性分析，采用Log Rank检验和单变量Cox比例风险回归进行K-M生存分析。基于time ROC分析及LASSO Cox回归，构建Signature预后模型。利用时间依赖ROC曲线与AUC对预后风险模型的预测能力进行评估。结果 初步筛选得到21个差异表达的铁死亡相关基因，经单变量Cox比例风险回归和K-M生存分析，进一步筛选得到7个预后相关的铁死亡相关基因。基于上述预后相关铁死亡差异性基因集进行Signature预后模型的构建，lambda.min=0.0317,Risk score=0.118×FANCD2+0.1514×SLC1A5+0.1632×SLC7A11。利用时间依赖ROC曲线与AUC对预后风险模型的预测能力进行评估，结果显示，1年预测效能AUC=0.773,3年AUC=0.667,5年AUC=0.658。结论 通过对TCGA测序数据库的挖掘，筛选并构建基于FANCD2、SLC1A5、SLC7A11三个铁死亡相关差异基因构建的预后风险评估模型具有良好的诊断效能，对HCC预后预测具有重要价值。

• 单位
  首都医科大学附属北京世纪坛医院