Hsa＿circ＿0008957靶MiRNA预测及其表达载体构建

作者：李仙仙; 鲁艳芹^*; 韩金祥^*

来源：罕少疾病杂志, 2022, 29(01): 85-88.

• COL1A2
• hsa＿circ＿0008957
• 快速克隆
• 生物信息学预测

目的构建Ⅰ型胶原蛋白结构基因COL1A2的靶向circRNA hsa circ 0008957其靶向miRNA的功能。方法采用circbase软件,获取hsacirc0008957序列,采用PCR进行circRNA克隆,通过同源重组接入circRNA表达载体pCD2.1。重组载体pCD2.1-hCOL1A2circ0008957通过PCR、双酶切、Sanger测序进行验证。利用circBANK,circinteractome网站进行hsacirc0008957靶miRNA及其功能预测。结果 pCD2.1-hCOL1A2-circ-0008957重组载体构建成功。Hsacirc0008957预测出该circRNA不具有蛋白编码功能,其靶miRNA hsamiR1305,hsamiR140-3p,hsamiR421,hsamiR548c3p和hsamiR628-3p与成骨相关,预测hsacirc0008957可能通过这些miRNA参与成骨分化。结论 Hsacirc0008957通过miR-1305、miR-140-3p、miR421、miR548c3p和miR6283p参与成骨分化,且预测COL1A2靶向miRNA与17种miRNA取交集,得出hsamiR618,该miRNA与肿瘤疾病相关,为后续在细胞水平上进一步验证hsacirc0008957的调节功能奠定了基础。

• 单位
  山东第一医科大学; 山东省医学科学院