拟诊为淋病患者中泌尿生殖道沙眼衣原体基因分型及序列分析

作者：张娟娟; 赵广录; 张丽君; 王峰; 洪福昌; 蓝丽娜; 吴肖冰; 陶小华; 张春来; 卢次勇; 冯铁建

来源：中华微生物学和免疫学杂志, 2010, 30(12): 1159-1163.

DOI：10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2010.12.022

• 淋病
• 沙眼衣原体
• 巢式聚合酶链反应
• 基因分型
• 序列分析

目的了解深圳市拟诊为淋病患者中泌尿生殖道沙眼衣原体的合并感染情况及其基因型分布和序列变异特点。方法采集401例拟诊为淋病患者的泌尿生殖道分泌物样本,应用Roche Amplicor全自动核酸检测系统对样本进行淋球菌和沙眼衣原体双检,提取DNA,应用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)扩增沙眼衣原体主要外膜蛋白基因(omp1)中的VS1～VS2片段,并对其进行序列测定,所获得的序列利用Mega7.0软件与标准参考株进行比对,分析确定其基因型及序列变异情况。结果 401例拟诊为淋病患者中淋球菌的感染率为82.3%(330/401),沙眼衣原体的感染率为24.2%(97/401),淋球菌和沙眼衣原体的合并感染率为21.7%(87/401)。97份沙眼衣原体阳性样本中获得73份沙眼衣原体基因片段序列,共检出8个基因型,分别为E型(27.4%)、G/Ga型(23.3%)、D/Da型(16.4%)、F型(13.7%)、J型(11.0%)、H型(5.5%)、B和K型(各1.4%)。序列分析发现3例(4.1%)菌株发生错义突变,分别为D/Da型、E型、G/Ga型;F型、H型、J型和K型序列虽多见碱基突变,但均为同义突变。结论淋病患者合并感染沙眼衣原体的比例较高,且泌尿生殖道沙眼衣原体的基因型以E、G/Ga、D/Da和F型为主。序列分析可以为泌尿生殖道沙眼衣原体的分子流行病学研究提供依据。

• 单位
  中山大学公共卫生学院; 深圳市慢性病防治中心