银杏古树群体叶片次生代谢物含量全基因组关联分析

作者：周琦; 李因刚

来源：分子植物育种, 2022, 1-11.

• 银杏
• 次生代谢物
• 全基因组关联分析
• 叶片
• 古树群体

银杏为银杏科落叶乔木，素有“活化石”之称。银杏是世界范围内的重要药用植物，其叶片含有对人类健康有益的次生代谢物，包括：黄酮类和内酯类。为探究银杏叶片次生代谢物含量的遗传调控规律，本研究利用高效液相色谱法（HPLC）对来自7个银杏古树群体的101份样品叶片的黄酮类、内酯类和银杏酸化合物的相对含量进行了测定，并对其进行了简化基因组测序，借此进行叶片次生代谢物含量的全基因组关联分析。结果表明，东部ZJ群体的黄酮类和内酯类含量丰富，而西南部PX群体的含量则相对较低。101份银杏样本共获得267.45 Gb的clean data，在参考基因组上的比对率平均为99.71%。最终，检测到8，915，709个原始SNP位点，经过滤共获得了125 501个高质量SNP位点。各样本的SNP得率为98.37%～99.41%，平均为98.95%。全基因组关联分析共检测到叶片次生代谢物含量相关的142个SNP位点和458个候选基因，分布于银杏12条染色体上，且候选基因的功能注释结果主要为代谢物相关。本研究不仅为银杏叶片次生代谢物含量遗传调控研究奠定基础，更为全基因组关联分析在林木重要性状的研究提供参考。

• 单位
  浙江省林业科学研究院