基于ITS2 DNA条形码的苞叶雪莲分子鉴定

作者：郝豆豆; 张勇群; 雷鸣; 拉多

来源：西南农业学报, 2018, 31(06): 1148-1154.

DOI：10.16213/j.cnki.scjas.2018.6.009

• 苞叶雪莲
• ITS2
• DNA条形码

【目的】基于ITS2条形码技术鉴定藏药材苞叶雪莲,以保证药材质量,确保用药安全。【方法】对采自西藏林芝的苞叶雪莲进行DNA提取,PCR扩增得到ITS序列并测序;所有样品的ITS2序列采用基于隐马尔可夫模型(HMM)的注释方法获得,使用MAGE6.0进行多重序列比对,并构建进化树,同时预测苞叶雪莲ITS2序列的二级结构。【结果】苞叶雪莲及其近缘物种的ITS2序列间存在明显差异,基于ITS2序列的NJ树及ITS2二级结构能将苞叶雪莲及其近缘物种区分开。【结论】ITS2序列可以有效的鉴别苞叶雪莲及其近缘物种,可以为苞叶雪莲的安全用药及合理开发利用提供依据。

• 单位
  西藏自治区人民政府驻成都办事处医院; 西藏大学