成人与新生儿来源的间充质干细胞circRNAs差异表达谱分析及功能预测

作者：梁甲武; 胡巍; 屈爽; 袁一方; 郭斌^*

来源：解放军医学院学报, 2020, 41(10): 1017-1022.

• hsacirc0080170
• hsacirc0060055
• 间充质干细胞
• 增龄
• 信号通路

目的筛选成人与新生儿来源的间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)的差异表达circRNAs,为进一步探究circRNAs在增龄调控MSCs细胞命运中的作用及机制提供理论基础。方法通过对微阵列数据GSE122178中的3例成人骨髓来源的间充质干细胞样本、3例围生期新生儿脐带血来源的间充质干细胞样本进行生物信息学分析,筛选差异表达的circRNAs,并预测其生物学功能和作用机制。结果新生儿脐带血来源的间充质干细胞与成人骨髓来源的间充质干细胞相比,66个circRNAs表达显著上调,107个circRNAs表达显著下调。其中hsacirc0080170表达上调最显著,hsacirc0060055表达下调最显著。hsacirc0080170具有6个下游miRNAs结合位点,714个靶基因;hsacirc0060055具有28个下游miRNAs结合位点,591个靶基因。KEGG分析显示,hsa-miR370和hsa-miR203a的靶基因显著富集到多能干细胞调控通路等31条信号通路;hsa-miR1225-5p和hsa-miR197靶基因显著富集到肌动蛋白细胞骨架调控通路等17条信号通路。结论成人和围生期新生儿来源的间充质干细胞circRNAs表达谱的差异提示,hsacirc0080170和hsacirc0060055可能在间充质干细胞的增龄调控中发挥作用。

• 单位
  解放军总医院