分子对接和网络药理学探究银翘散治疗COVID-19机制

作者:陶悦; 聂承冬; 温静; 杨洋; 马其华; 王冲; 阎新佳*
来源:哈尔滨商业大学学报(自然科学版), 2021, 37(01): 3-20.
DOI:10.19492/j.cnki.1672-0946.2021.01.001

摘要

通过网络药理学分析和分子对接来探究银翘散治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)作用机制.通过TCMSP数据库、PubChem数据库和SymMap数据库获取银翘散的主要成分和其蛋白靶点,对银翘散主要成分与常见抗病毒西药通过PyRx 0. 8进行分子对接比对.借助Cytoscpe3. 7. 2软件构建银翘散的药材-活性成分-靶点网络相互关系网络.通过string平台获取蛋白相互作用关系网络(PPI),基于网络节点拓扑结构分析筛选出银翘散核心靶点.采用DAVID数据库对核心靶点进行GO及KEGG分析,并对KEGG信号通路进行可视化.通过分子对接结果得出银翘散共有121种活性成分,血管紧张素转化酶II (ACE2)和SARS-CoV-2水解酶的可能的结合区域各有4个.通过拓扑结构分析得出核心靶点99个,参与生物过程条目99个、细胞组成条目12个、分子功能条目23个信号通路86条,且多与病毒和肺损伤有关.通过分子对接和网络药理学对银翘散进行了系统研究,为银翘散复方治疗新型冠状病毒(SARS-CoV-2)和新型冠状病毒肺炎(COVID-19)研发药物和疫情防控等提供了理论参考和指导.

  • 单位
    哈尔滨商业大学

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