摘要
目的 建立临床医学研究中便捷易用的质粒基因注释可视化系统,用于直观展示质粒结构与基因分布。方法 运用Perl语言编写VPA系统4个主要模块(文件配置模块、颜色系统模块、图形生成模块和出错帮助模块),生成Perl脚本VPA.pl。结果 构建了质粒基因注释可视化系统VPA,该系统可实现多种类别、不同长度质粒的基因注释可视化显示,展示信息丰富全面、操作简单便捷。结论 VPA系统可适用于目前细菌研究中常见的大部分质粒基因注释工作,为细菌的比较基因组学和结构基因组学提供了更直观的图像展示,并为其他相关可视化系统的开发提供了参考模型。
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单位病原微生物生物安全国家重点实验室