rDNA-ITS序列分析对临床少见丝状真菌鉴定作用的评估

作者：郑冰; 应春妹; 汪雅萍; 叶杨芹; 张灏旻

来源：检验医学, 2011, (10): 648-652.

• 内转录间隔区
• 基因测序
• 丝状真菌
• 形态学鉴定 Internal transcribed spacer
• Gene sequence
• Filamentous fungus
• Morphological identification

目的评价内转录间隔区(ITS)的多态性序列分析(rDNA-ITS序列分析)对临床少见丝状真菌的鉴定作用,以形态学鉴定方法加以补充验证。方法将3株待检真菌通过聚合酶链反应(PCR)扩增和基因测序方法分析rDNA-ITS序列,从GenBank获取相似序列,使用BLAST工具对rDNA-ITS序列进行对比分析,利用GenBank中的系统发育软件自动生成系统,构建系统发育树,根据系统发育树并结合对比指标确定距离与同源性均有较大鉴定意义的对比序列,并与真菌ITS1、ITS2、26S rDNA D1/D2片段的序列分析结果及形态学鉴定结果进行比较。结果 2株菌株能通过rDNA-ITS序列分析的方法鉴定到种...

• 单位
  上海交通大学医学院附属仁济医院