辣椒SRO基因家族鉴定与组织特异性分析

作者：张永兰^*; 党万玛; 董莉莉; 石天龙; 张宇斌

来源：分子植物育种, 2023, 21(14): 4560-4567.

DOI：10.13271/j.mpb.021.004560

• 辣椒
• SRO
• 生物信息学

大量研究表明，SROs与植物非生物胁迫和生长发育息息相关，具有PARP、RST和WWE 3个特征结构域。辣椒是人们日常食用的一类蔬菜，有必要研究其对非生物胁迫的耐受性以提高产量。基于辣椒已公布的基因组数据，进行双向BLAST比对，获得5个辣椒SRO基因家族成员，分别为CaSRO1～CaSRO5。利用NCBI-CDD工具进行基因结构分析表明，每个CaSRO基因含有4～6个外显子。组织特异性表达谱显示CaSRO3和CaSRO4在辣椒的根、茎和叶3个不同组织中的表达存在差异，具有组织特异性。系统进化树分析可以聚为2个亚类，T459＿00928、T459＿17068和T459＿03742为第Ⅰa类；T459＿10290为第Ⅱb类。综合分析5个辣椒SRO基因家族成员发现，T459＿00928、T459＿17068和T459＿03742是辣椒应对非生物胁迫的重要基因。本研究有助于揭示植物的基本生物学特性，为辣椒在非生物胁迫方面的研究提供一定的理论支持。

• 单位
  贵州师范大学; 青海柴达木职业技术学院; 生命科学学院