浙江楠全基因组调查

作者：张月婷; 郑永杰; 刘新亮; 李升星; 戴小英; 伍艳芳

来源：分子植物育种, 2021, 1-8.

• 浙江楠
• 全基因组调查
• 基因组大小
• GC含量

浙江楠是重要的材用和园林绿化树种，但对其分子生物学的研究有限，全基因组测序成为深入研究浙江楠分子生物学的关键。本研究利用高通量测序技术(Illumina Hiseq 2500)开展了浙江楠基因组大小测定，并利用生物信息学方法对其基因组大小、杂合率及重复序列比例等一些基本信息进行统计。主要结论如下：浙江楠基因组大小为1 060.06 Mb，杂合率为2.18%，重复序列比例为58.81%，GC含量为40.81%。基因组各指标的统计结果表明，浙江楠基因组较大，且具有较高的杂合率，测序难度较大，后续浙江楠全基因组测序需要利用二代(Illumina)与三代(PacBio)测序技术相结合的方式进行，将有利于高质量全基因组的获得。

• 单位
  江西省林业科学院